Die BLS Schifffahrt AG betreibt die Schifffahrt auf dem Thuner- und auf dem Brienzersee. Sie gehört zu den grössten Tourismusanbietern im Berner Oberland und der Hauptsitz liegt in Thun. Insgesamt sind rund 114 Mitarbeitende bei der BLS Schifffahrt beschäftigt. 

Seit dem 01.01.2022 ist die BLS Schifffahrt AG eine eigenständige Tochtergesellschaft der BLS AG. Die BLS AG besitzt 100% der Aktien der BLS Schifffahrt.